用Excel算Student’s t test

紀錄

假定A, B是同一物種的兩個群，我們針對I, II, III三種項目分別對A, B進行檢測，結果如下

 

我們想要比較A, B兩群體分別在I, II, III項目的表現上是否有統計上的差異

這時候這樣設定:

 

在想要填入P-value的空格處點一下

 

點選公式>插入函數

 

選擇TTest

 

分別框選A, B中想要比較的項目

 

Tail: 單尾分布填1, 雙尾分布填2

Type: 成偶填1, 具有相同變異數填2, 具有不同變異數填3

 

接著P-value就會自動幫你算好了

Real Time-PCR / Quantitative PCR Primer設計

使用軟體: ABI Primer Express 2.0

 

1.上NCBI，用Nucleotide資料庫找出所要的Gene sequence。把ATCG序列存下來到記事本(建議用Fasta偶模式存)

 

2.打開Primer Express，點選File>New>TagMan MGB Probe & Primer Design

 

3.點選Import DNA profile，選剛剛存下來含ATCG序列的記事本，程式會自動編排好

 

4.點選Options>Find Primers/Probes Now。程式會自動幫你找出可以當Primer/Probe的位置 (接下來我們人工要做的就是確定這段序列會不會有太多的CG鍵結，因為CG鍵結含3個氫鍵要打斷不像AT鍵結那麼容易

 

5.分頁切換到Primer

6.點選Options>Show Primer Secondary Structure。視窗會顯示出該段Primer的CG鍵結數目，依序比對直至找到適當序列

7.若沒有找到適當的Primer，把原來程式挑出來的位置給剔除，讓程式再找一次 (要是還找不到就真的沒辦法了)

豬頭記帳-簡單好用的記帳軟體

這是一個簡單好上手的記帳軟體
沒有複雜的表格及眾多的功能，輕鬆就能上手
簡單，所以容易持之以恆

豬頭記帳
下載點:作者部落格
作者的軟體介紹

從2008年到現在，每天睡前花個一分鐘紀錄
終於，我驚訝地發現自己2009年生活費竟然近15萬元!

介面參觀：

↑清楚的統計介面呈現

↑可自訂的分類及子項目

暑期研究-研究血液抹片

在暑期研究的前半段期間，我有許多時間是花在血液抹片的製作上

從推血片、染色原理、照相、整理成ppt檔到做人工CBC

許多都是之前在學校學習過的，這次著實有了許多機會來練習

 

值得一提的是，在中研院這裡有非常好用的機器可以來照玻片

這一台顯微鏡有連接到照相機，可以直接將玻片照存成電子檔

就不用像以前在學校克難地用數位相機拍玻片了

 

用它拍出來的玻片照非常地漂亮

這是歡歡學長血液抹片Liu’s stain下的樣貌:

嗜中性球(Neutrophil)

 

小淋巴球(Small lymphocyte)

 

單核球(Monocyte)

 

嗜酸性球(Eosinophil)

 

一顆顆白血球都看得很清楚呢

讓我好想把組織、寄蟲的玻片也搬來用台照相機照個夠

果真照相是看摳摳的，不管是風景照還是玻片照

 

一直都懷著莫名蒐集玻片照的動力

現在，周邊血血球玻片只差最難找的嗜鹼性球了

希望之後能有幸把它難得一見的玉照補上:)

釣美國螯蝦

今天從研究室出來，要往餐廳的方向移動

路上經過生態池發現有群人圍在那邊，旁邊還有一籠美國螯蝦

原來是志工在想辦法減少外來種美國螯蝦的數量

之前我也養過螯蝦一陣子

今天遇到這件事真是有夠新鮮，於是我就在旁邊跟著看他們怎麼釣螯蝦

 

他們準備的器材有網子、綁上餌(豬肉或蝦肉)的線、夾子及籠子 (最好還有手電筒)

首先把餌拋入池子，一端固定在欄杆上

這時候繩子會呈鬆垮的狀態 (以下為自製示意圖):

 

 

之後靜靜等待

螯蝦來吃餌食時，會本能地把餌食扯到安全的角落去

這時候就會看到線慢慢地繃緊

接著要用適當力道，欲擒故縱地慢慢把蝦子拉過來(美國螯蝦的力氣不小唷)

距離夠近了之後，適當施力上抬讓蝦子呈半漂浮狀態，離開池底

接著網子下去把它撈起來，就大功告成了

 

話說，池塘裡出現美國螯蝦，其實並不是一件好事

它其實是一種外來種，適應力強、又會捕食其它魚蝦類，造成原生種動植物的傷害

 

聽志工大哥說

之前來最多一次可以抓80幾隻螯蝦走

多的時候甚至在池旁就可以看到一些小螯蝦走來走去

他估計，這個池子裡應該有上千隻以上的螯蝦

 

而這

全是任意棄養、及隨意放生的後果

他說，曾經看到一位婦人在這個池子「放生」10幾隻螯蝦

殊不知螯蝦一胎可以懷幾百顆卵

放進這個池子裡

不用多久，它們就可以繁殖成現在的上千隻螯蝦，釣也釣不完(而且又沒有天敵)

對池子裡原來的魚蝦、蝌蚪造成傷害

 

所以千萬千萬，不可以任意棄養或是放生動物

一個個無心的惡行，或許就這樣產生了

SMPlayer-全能播放器

網路上的影片格式千千萬萬種(AVI, Wmv, Mpeg, RM,…)
這裡面有許多是Windows內建的Media player不支援的格式

在使用過了KMPlayer, GOM player,…等等許多全能播放器後
我覺得還是Smplayer最好用
支援幾乎所有的影片格式、快捷鍵操作、免安裝、極度地流暢
雖然它仍還是有幾個小問題，且50MB左右的大小並不算輕巧
但對於懶得抓編碼包的我來說，真是一個最好的選擇

SMPlayer: Portable Freeware Collection下載點
大小: 43MB

註
使用之後發現的兩個問題:

1. 中文字幕會變亂碼
2. 檔名若不是中/英文的檔案無法播放 (調整檔案名稱即可)

第1個問題，在中文字幕的播放問題上，必須要更改一些設定才行，如下

A. 點選 選項>偏好設定>字幕
在Default subtitle encoding的部分選擇「正體中文(BIG5)」

B. 然後到 字體
勾選TTF font，路徑選擇「C:\WINDOWS\Fonts\kaiu.ttf」
(這是Windows作業系統下的標楷體)

這樣子就可以正常播放繁體中文的字幕了

更新部落格樣式

把之前從Blogger template抓的樣板給替換掉了
這個網站提供的Template雖然選擇眾多，但有些設定不是很完善
自由度及各瀏覽器的支援度有可能出問題，端看原作者的用心

現在使用的樣板是從Metamuse提供，再加上一些網友的Hack改成的
我很喜歡這個網站提供的Template，他所釋放出來的Template中，我還沒遇到一些意外的小瑕疵，自由度也很良好

這個Template所使用的Hack有：

1. 在文章裡顯示優質的程式碼區-良人的大秘寶
2. 淡入/淡出效果的繼續閱讀功能-OVER30-MAN
3. Google analytic語法 (2010/07/10: 發現google實驗室已經內建此功能，考慮拿掉中)
4. 加入相關文章功能-Abin's Tech Note (2010/07/10新增)

背景圖用的是最近的九族櫻花祭，九族每年這時候的晚上都特別地美

血液抹片染色 (hematological stains)

這個禮拜三Group meeting的報告是負責介紹Staining

包含Stain history, Wright’s stain, Giemsa stain, Liu’s stain, PAS stain (bonus)

 

上個禮拜做了很多片的Liu’s stain & PAS stain

查了資料之後，這下對Staining的了解又更多了:)

 

Liu’s stain

Procedure

1. Cover the slide with 5~6 drops of Liu A. Wait 30 seconds.
2. Add 2 times of Liu B on the slide. Mix well by blowing the surface. Wait 60 seconds.
3. Wash off the staining solution with running tap water(at the back side).
4. Dry and cover

 

PAS stain

1. Procedure
2. Warm the Schiff’s reagent to room temperature
3. De-wax and hydrate paraffin sections
4. Oxidize for 10-30 min in periodic acid
5. Wash in running tap water for 3 min
6. Immerse in Schiff’s reagent for 20 min
7. Wash in running tap water for 10 min
8. Apply counterstains, as desired ( hematoxylin, 90 sec)
9. Dehydration in alcohol
10. Clear in xylene and cover

 

完整報告(pdf)

台北宿舍蜘蛛記

今天是台北跟實驗室第二個禮拜的星期一

昨天一回到住處，就看到一隻快5公分大的蟑螂在家具上沉穩地行走

這還是頭一次蟑螂大到讓我有點害怕

不過我還是立刻拿起拖鞋，但後來被它逃掉

 

沒過多久就在我去廚房拿水喝時，又發現角落有團「黑物」

靠過去一瞧

 

天吶是大蜘蛛!!

 

「它是益蟲、它是益蟲…」

 

強忍著想要除之而後快的念頭及天生的恐懼感，我伸長了手給它拍了上面那張照

並且不打算對它動粗

 

結果當天要睡覺時，被我逮到一隻澳洲大強

正法後，去廚房一看

「蜘蛛還在!」

 

於是我把蟑螂拋向蜘蛛，並精準落點在蜘蛛旁

等我刷個牙回來蜘蛛有動作了，詳見下圖

 

 

早上起床

蜘蛛消失；蟑螂成碎片

 

 

今天晚上回來

一進門，沒蟑螂…(很好)

一進廚房，沒蜘蛛…(很擔心)

 

放好東西、開了電腦，接著準備洗澡

 

媽呀蜘蛛在浴室裡啦!!!!

 

 

想著就這樣放著它家裡到處跑也不好

要是睡覺時跑到床上那我一定會嚇到跳起來

 

於是我開始「牧蜘蛛」

希望把它趕回廚房

當然蜘蛛很不乖，一下爬到臥室一下爬去別的房間…

 

最後，蜘蛛被我軟禁在此-.-

 

要是還有抓到蟑螂，我會餵你的

還有，希望你不會爬出來…